Można skonfigurować kilka preferencji globalnych programu MIB Manager za pomocą okna Preferencje.
Aby skonfigurować preferencje globalne programu MIB Manager, należy kliknąć opcję 
Preferencje lub wybrać z menu opcję .
W oknie Preferencje można skonfigurować preferencje ogólne oraz preferencje dotyczące katalogu, eksportu, rejestrowania i wyszukiwania.